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单细胞RNA测序技术揭示与疾病进展和免疫相关的急性髓系白血病分型

更新时间:2020/8/12 14:42:52 浏览次数:2346

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由于急性髓系白血病(AML)是一种异质性疾病,存在于复杂的微环境中,使得了解不同细胞类型对该疾病影响的研究变得复杂。为了探究其机理并作为医学参考,来自哈佛医学院的Bradley E. Bernstein研究团队在Cell杂志(IF=24.38)上发表了题为“单细胞RNA测序技术揭示与疾病进展和免疫相关的急性髓系白血病分型”(Single-Cell RNA-Seq Reveals AML Hierarchies Relevant to Disease Progression and Immunity)的学术论文。该工作分三个步骤对急性髓系白血病患者的单个细胞进行转录组学和基因突变结合分析。

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第一步,该研究将单细胞RNA测序和基因分型相结合,对40例骨髓标本中的38410个细胞进行了分析,其中包括16例AML患者和5例健康捐赠者;第二步使用机器学习分类器来区分恶性细胞类型的光谱,这些恶性细胞类型的丰度在不同患者之间和同一肿瘤的亚克隆种类之间都有所不同;第三步根据得到图谱结果,发现其存在明显的功能亚群和相关驱动因素。


研究表明,细胞类型组成与原型遗传病变相关,原始AML细胞表现出转录程序异常,同时表达干细胞和髓细胞启动基因。分化的单核细胞样AML细胞在体外表达多种免疫调节基因并抑制T细胞活性。该研究提供相关单细胞技术和包括AML细胞状态、调节因子和标记物的图谱,为精准医疗和免疫治疗提供参考。


该研究有助于深入了解原始AML细胞异常的调控机制,揭示其发育层次与肿瘤遗传学之间惊人的一致性,同时识别出具有免疫抑制特性的分化AML细胞,该研究还可以指导针对恶性肿瘤关键特异性成分的治疗策略。


原文链接:

https://doi.org/10.1016/j.cell.2019.01.031


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