2020年美国临床肿瘤学会(ASCO)摘要投稿结果揭晓,中国临床专家和思路迪共同合作的39项科研成果将会亮相此次ASCO年会。今天汇报跨癌种的临床研究结果,覆盖免疫治疗、靶向治疗和基因变异特征分析等多个领域。从临床问题出发,为中国肿瘤患者的精准治疗提供更多科学依据。
ARID1A基因作为潜在的免疫检查点抑制剂生物标志物的泛癌种分析 (3540)
研究分析了MSKCC的10336例泛癌种测序结果,和15849例中国泛癌种NGS测序结果,对比了不同人群不同瘤种中ARID1A基因变异情况、肿瘤突变负荷。中国泛癌种分析结果显示,与ARID1A野生型相比,突变型患者具有更高的肿瘤突变负荷;两组独立的NSCLC的免疫治疗队列分析结果均提示,ARID1A突变与免疫治疗疗效正相关。
中国实体瘤ALK融合特征(3555)
研究共纳入4万例患者,NGS方法检测ALK融合形式。其中72例患者中包含了52种不同的ALK融合,其中35种为新的融合形式。在所有ALK融合中,肺癌占最大比例,其次为大肠癌,肝癌,胆道癌,黑色素瘤,癌肉瘤和炎性纤维母细胞瘤等。本次检测中最常见的ALK融合伴侣为KIF5B,DCTN1和STRN。新的融合形式CLIP4-ALK,EHBP1-ALK和PLB1-ALK均在不同的患者中检测到两次。
中国肿瘤患者CDK12突变发生频率及CDK12突变与TMB和预后的相关性(e13663)
研究共纳入15745例中国实体瘤患者,均接受组织NGS检测,CDK12任何形式突变和有害/疑似有害突变比例分别为3.8%和0.62%,在前列腺癌和乳腺癌中突变比例最高,其它癌种中不到1%。TCGA数据显示CDK12突变在前列腺癌和胆管癌中是不良预后因子。泛癌种公共队列数据分析显示CDK12突变患者TMB更高,可能从免疫治疗中获益。
MUC5B在多个瘤种中与更好的预后相关(e13515)
研究纳入TCGA数据库全瘤种分析(27个瘤种),MUC5B突变与野生型相比,在子宫内膜癌、膀胱癌和肺腺癌中跟更长的疾病特异性生存期(DSS),无进展生存期(PFS)和总生存期(OS)有关。但是在头颈鳞癌中,MUC5B突变提示更差的PFS和OS。机制分析提示,DNA损伤修复通路在子宫内膜癌、膀胱癌和肺腺癌中进一步富集,但是在头颈鳞癌中却没有。提示DNA损伤修复增强,可能是MUC5B提示更好预后的机制之一。
TGF-β通路在肿瘤患者中的变异图谱及其在免疫调节中的作用(e15187)
研究纳入三个泛癌种队列。分析结果提示TGF-β通路变异与实体瘤的高度微卫星不稳定性,高水平肿瘤突变负荷,及高水平新生抗原负荷均呈正相关(p< 0.001)。此外,TGF-β通路变异与不同的免疫相关基因表达特征相关,进而影响免疫治疗疗效。
中国人群泛癌种PD-L1表达与TMB分布(e15267)
PD-L1表达与TMB是免疫治疗疗效最有效的预测biomarker,本研究分析了上万例中国人群泛癌种PD-L1表达与TMB分布,并检测了二者的相关性。
PD-L1变异和PD-L1表达的关系:泛癌种分析(e13661)
研究共纳入10002例患者,其中1%的患者发生PD-L1基因变异。PD-L1变异的患者比野生型患者的PD-L1表达更高(P < 0.001)。相比于PD-L1基因点突变(10/24,42%)和PD-L1拷贝数减少(0/3,0%)的患者,PD-L1阳性表达更常见于PD-L1基因重排(1/1,100%)和PD-L1拷贝数增加(46/59,78%)的患者。
JAK1/2表达、免疫相关基因和JAK2基因变异的相关性:泛癌种分析(e15057)
研究纳入10071例患者,相比于JAK1,JAK2表达与46个免疫相关基因表达的正相关性更强。363 (3.60%) 的患者发生JAK2基因变异,JAK2表达在JAK2基因变异的患者和野生型患者中没有显著差别。然而,JAK2基因重排 (8/363,2.20%) 和JAK2基因扩增(116/363,31.96%)的患者JAK2表达更高。
中国万例泛癌种患者FGF/FGFR通路变异图谱(e13503)
研究共纳入12,372例中国实体瘤患者,共覆盖超过21个瘤种。组织NGS检测结果显示FGF/FGFR通路变异频率最高的瘤种为食管癌(54.1%),泌尿系统肿瘤(40.7%),及头颈肿瘤(28.4%)。通路中突变频率最高的基因为FGFR SNV(5.13%)及FGF扩增(5.08%)。此外,FGF/FGFR通路突变与MSI-H状态呈正相关(p<0.001)。
17993例实体瘤患者的RAS基因突变图谱(e15615)
研究纳入17993例的实体瘤患者(22个瘤种),接受组织NGS检测,覆盖单核苷酸突变和拷贝数变异,致病变异和可能致病变异纳入分析。总体RAS变异的比例为23.09%,KRAS是最常见的变异基因,在胰腺癌中分布最常见(685/842, 81.35%)。KRAS G12C/D/R/V存在于21个癌种中,最常见于结直肠癌、胰腺癌和肺癌。KRAS G12C,G12D,G12R和G12V的突变频率分别为9.24%,34.73%,3.54%和21.66%。
IDH突变在实体瘤患者中的分布:一项泛癌种分析(e13638)
研究共纳入12,372 例中国实体瘤患者,接受组织NGS检测。研究发现IDH突变频率为0.8%,其中IDH1和IDH2为IDH常见变异基因。所有IDH突变病例中,胆道癌49例(47%),肝癌25例(24%),肺癌16例(15%),结直肠癌7例(7%)。IDH1 R132C突变占所有IDH突变的45.7%。此外,IDH1/2突变患者中,TP53和ARID1A为高频突变基因。
中国实体瘤患者融合基因图谱(e15039)
随着larotrectinib等以融合基因新生抗原为靶点的靶向药物获批,研究融合基因图谱、及其与靶向治疗和免疫治疗的关系,变得尤为重要。该研究回顾性分析了7514例中国实体瘤患者的组织NGS检测结果,明确了融合基因在中国实体瘤患者中的检出率(包括单融合基因、双融合基因和三融合基因发生在同一患者的概率)、高发的基因及其主要伴侣基因。另外,该研究在融合基因与TMB-H、MSI-H的关系中也有惊人发现。
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