近日,赛默飞与美国疾病预防控制中心(CDC)特殊细菌学参考实验室合作,研发出一种先进的软件解决方案,通过该软件解决方案,研究人员不需要引用多个数据库,而是通过一个领域专家就能够更快的识别微生物病原体在全球爆发的潜在根源。
赛默飞设计的MicrobeBridge软件平台可以无缝连接到Sanger测序结果的MicrobeNet数据库。目前,分析测序数据分散在多个软件包中。MicrobeBridge软件平台使研究人员能够更容易地访问存储在MicrobeNet中的公共卫生信息,并提供基础实验室监测和疾病暴发的整体理解。
"以DNA为基础的微生物鉴定技术已经成为公共健康科学家们识别和追踪传染病疫情的一个有效工具," 赛默飞公共卫生部主任Dan Didier说。"然而数据分析降低了公共卫生实验室迅速采取行动的能力。MicrobeBridge软件平台克服了研究人员装备技术上的障碍,帮助研究人员更快地应对威胁人类健康的病原体。"
MicrobeBridge集成所有应用生物系统毛细管电泳仪器和原始Sanger测序数据的自动化组装和质量控制到一个可搜索的格式化MicrobeNet数据库中,从而最大限度的减少匹配和识别标本所需的工作量。赛默飞还计划为下一代测序和质谱平台开发兼容软件。
"对我们特别采集的高度优化病原体数据库来讲,扩大MicrobeNet将允许公共卫生实验室在世界任何地方得到序列、表型或其他最终的测试和匹配结果," CDC特殊细菌学参考实验室,细菌特殊病原体分部,高病原和病理结果控制中心主管John R. McQuisto博士说。通过添加MicrobeBridge,研究人员和公共卫生实验室现在能够轻松地获得由疾病预防控制中心病原体专家提供的成千上万的生物信息"。
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