
近日,分子医学研究院王鹏飞团队联合仁济医院检验科李敏团队在《Advanced Science》(IF:14.1)期刊发表题为“Allosteric DNAzyme-Enabled Sensitive and Multiplex Detection of Biomarkers for Rapid Diagnosis of Urinary Tract Infections”的最新研究成果。该研究开发了一种名为SMART(Sensitive and Multiplex detection of ATP and miRNAs for UTI diagnosis)的新型单分子DNAzyme生物传感体系,实现了尿液中小分子与核酸标志物的高灵敏、多重、一锅检测,为尿路感染(UTI)的快速精准诊断提供了全新技术方案。
尿路感染(UTI)是临床最常见的感染性疾病之一,目前临床UTI诊断金标准为尿培养法,但存在检测周期长(24–48小时)、灵敏度有限、对苛养/厌氧菌检出率低等问题,难以及时指导临床用药。近年来,ATP、microRNA等宿主反应分子逐渐被认为是潜在的诊断标志物。然而,现有方法难以实现ATP与miRNA等不同类型标志物的一锅同步检测,通常需多平台、多步骤处理且依赖精密仪器,难以满足快速临床检测需求;同时,传统DNAzyme体系受多组分设计限制,存在背景泄漏和催化效率低等问题,检测灵敏度难以满足超痕量标志物分析。
针对上述问题,研究团队创新性构建了一种单分子变构DNAzyme传感体系SMART。该体系将“靶标识别模块”和“DNAzyme催化模块”集成于一条单链DNA中,通过结构设计引入自锁定(self-locked)机制:在无靶标时体系处于关闭状态;当ATP或miRNA等目标分子结合后,引发分子构象重排,激活DNAzyme催化活性,实现对荧光底物的高效切割,从而产生可检测信号。该设计将传统多组分DNAzyme体系升级为单分子可编程系统,有效避免了组分比例失衡、背景泄漏等问题,大幅提升检测效能。
在性能方面,SMART体系展现出显著优势:对ATP检测灵敏度达到皮摩尔(pM)水平,对miRNA检测灵敏度达到飞摩尔(fM)水平;同时可在单一反应体系中实现4种标志物的并行检测,且无需核酸提取或扩增步骤,整体检测时间约2.5小时。进一步地,研究团队将SMART应用于164例临床尿液样本分析,并结合机器学习模型建立诊断体系,实现了95.5%的诊断准确率,显著优于传统检测方法的时效性和综合性能。
该研究的核心创新在于提出了“单分子变构DNAzyme”新范式,突破了传统DNAzyme体系依赖多组分组装的限制,为多标志物一体化检测提供了通用平台。该策略不仅适用于尿路感染诊断,还具有向肿瘤、代谢疾病等多种疾病标志物检测拓展的潜力,在分子诊断和即时检测(POCT)领域具有广阔应用前景。
本研究共同第一作者为分子医学研究院博士生沈彦哲、史辰致与仁济医院检验科副主任技师马硝惟,分子医学研究院研究员王鹏飞、副研究员杨栋磊与仁济医院检验科主任李敏为共同通讯作者。该技术由分子医学研究院与检验科联合开发,本研究得到了国家重点研发计划、国自然面上项目以及上海市地方高水平大学创新团队等项目的资助。
论文链接:
https://doi.org/10.1002/advs.75417
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