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将融合基因一网打尽,金域医学RNA测序助力血液肿瘤精准诊断

更新时间:2022/11/9 11:21:42 浏览次数:6686

  一个多月前,50岁的老徐在工作中突然感到持续的腰背疼痛。原本以为是劳损所致,便不以为意。半个月后,他发现不仅疼痛症状没有改善,还进一步出现了双下肢疼痛麻木症状。无奈之下,老徐只能尽快前往医院就诊。

  在经过形态学和流式细胞术的检查后,临床医生根据指标将诊断方向聚焦在急性髓系白血病(AML)中的一种——急性早幼粒细胞白血病(APL)。为了明确诊断,并指导用药和预后评估,临床医生进一步安排老徐接受融合基因检测时,却惊讶地发现,老徐的样本没有检测到APL患者进行药物治疗需要的特征性(PML::RARA)融合基因的存在。

  这令临床医生感到了困惑和担忧,考虑到原有的融合基因检测方法主要检测的是常规的(PML::RARA)融合变异,对于其他相关罕见融合基因会存在漏检可能,临床医生将老徐的样本送至了金域医学603882)进行血液肿瘤RNAseq融合基因检测。结果显示他携带的是 (ZBTB16::RARA)罕见融合基因。

  这是一种仅1%的APL患者会带有的罕见融合基因。根据文献报道,带有该融合变异的APL患者在临床治疗中对常用药物全反式维甲酸反应差,需要结合G-CSF等药物治疗才能获得完全缓解。这一信息最终为临床医生制定更加精准、个性化的治疗方案以及进行预后评估提供了有力的支持。

  融合基因和血液肿瘤产生密切相关

  融合基因可以导致异常序列或功能的蛋白质产生,或者是引起某些基因表达的失调,从而导致或促进肿瘤的发生。在血液肿瘤领域,融合基因是其常见的分子生物学异常。通过检测融合基因,可帮助临床进行辅助诊断、病因探寻、预后评估、用药指导和寻找微小残留病(MRD)监测分子标志物,建立适合患者的精准治疗方案,避免治疗不足或过度治疗。

  随着检验技术的更新,以及行业对血液病分子生物学研究的深入,越来越多的融合基因和血液病的发生、发展机制之间的关联被逐渐明确。因此,针对初诊的血液肿瘤者,融合基因的检查是必不可少的。另外,对于疑似血液肿瘤但没有找到致病原因的患者,以及血液肿瘤复发的患者,都有必要进行全面的融合基因检查。

  传统的融合基因检测大都是先通过染色体核型分析、或者FISH进行检测,血液肿瘤中较为常见、并伴有特征性染色体易位的融合(如BCR::ABL1和PML::RARA)都是通过这种方式发现和鉴定。但是,相当比例的患者可能因隐匿性染色体易位或者微缺失等原因导致基因的异常拼接和融合,这些融合基因用常规的免疫组化、PCR、核型分析或FISH等手段难以检测。

  随着NGS二代测序平台的出现,以及生物信息学分析工具的开发,RNA测序应运而生。利用RNAseq检测,可以对血液肿瘤中的常见、罕见和新发的融合基因进行全方面检测,弥补目前传统融合基因检测手段的不足。通过RNA测序技术,新的融合基因还在不断地被发现和报道。

  金域医学二代测序平台

  金域医学血液肿瘤RNAseq测序服务

  将融合基因一网打尽

  老徐的融合基因检测,正是在金域医学的测序平台上完成的。金域医学成立血液病诊断中心已超10年,一直紧跟临床,完善、升级服务,推出了一系列血液肿瘤RNAseq融合基因检测服务。依托全转录组全面覆盖和靶向测序精准检测的不同优势,金域医学系列血液肿瘤RNAseq融合基因检测服务包括了全转录组测序和靶向RNA测序,可以将融合基因一网打尽。“全转录组”既能够做到检测融合基因,还能够检测到基因突变;而靶向融合基因检测具有更高的灵敏度,其中,“靶向106基因”最低能检测到比例大于1%的融合基因。这一系列全面的检测项目,能满足各级医疗机构的需求,辅助精准诊疗。

  目前,金域医学已发现了超100个从未被报道过的罕见融合基因,积累了丰富的检测经验与技术认知。未来,金域医学也还将不断整合各技术平台并完善自身服务能力,为患者提供更加全面和精准的技术方案,用更加全面、准确与易用的技术方案支持临床医生做好各类血液肿瘤的诊疗工作。

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