深圳市医管中心在医院运营模式、人事制度、医疗服务模式、物资招标采购等一些关键领域的改革取得了突破进展。

2014年上半年，在人事制度综合配套改革上，市医管中心会同人力资源保障局拟订了综合配套改革指导意见；制订了市属公立医院绩效工资总额核定办法和以医务人员技术劳务价值为基础的奖励性绩效工资分配指导意见。医疗人才评价制度改革启动，借鉴国际标准，完成了11个临床学（专）科的临床医生技术等级评价指标体系的制定；其中肝胆胰外科、胸外科、神经外科、耳鼻咽喉科和眼科已进入医生等级评价试点阶段。

在物资招采方式改革上，市医管中心以集团化采购的方式完成了一次性使用注射器等4类通用医用耗材的招标工作，四类耗材的平均采购成本降低了30%左右。医院运营标准化取得突破进展。临床检验中心等6个质量控制中心建设项目启动；制定了护理服务、床边检验、感染控制等一系列服务标准；形成了200多个护理"品质管理圈";开展了美国病理学家学会认证、国际临床试验标准化认证。

医院诊疗服务模式改革继续深入，拟定了医疗联合体建设实施方案，拟与龙岗区合作，推动建设大医院、街道医院和社康中心一体化运作的区域性医疗联合体。推动建设专科医院联盟，如市眼科医院建设重大致盲眼病防治平台和市眼外伤救治网络、心血管医院筹建市心脏急危重症急救中心和"大血管外科"联盟。制定了市属医院与康复医疗机构康复医疗服务双向转诊技术标准，推动康复患者双向转诊工作。市属医院全面加入北京301医院远程医学联网。国家病理远程会诊中心深圳中心将在年底开放使用。依托北大深圳医院与冲绳医师学会建立"深圳-日本"质子重离子肿瘤治疗海外转诊转介平台。

2014年下半年，市医管中心还将推动医疗价格和医疗收、付费方式改革。以新建市属医院和眼科医院为试点，推动医院人事制度综合配套等改革。