近日,英国伯明翰大学Nicholas Loman团队开发了一个埃博拉病毒基因组监测系统,并且可以用标准的航空行李运送到疾病检测现场,可以在样本收集24小时内得出检测结果。在发表于《自然》的一项研究介绍了在西非几内亚最近的埃博拉疫情中,成功使用该系统进行的实时监测。
西非埃博拉病毒新玛可拉(Makona)毒株已导致超过11000人死亡,该病毒平均每个基因组中有16~27个遗传变异。基因组测序可以用来追踪这种变化,且日益受到医护工作者的欢迎,因为只要测序结果分析得足够快,就可以给他们提供信息并采取病毒控制措施。然而,由于当地缺少测序能力,且远距离运输样本测序有难度,西非埃博拉疫情期间采取基因组监控十分零散。
Loman团队开发的基因组监测系统使用一个重量不足100克的DNA测序装置,既可以用标准航空行李运送,也可以插入笔记本电脑的USB接口。研究团队使用该系统测序并且分析了2015年3~10月收集的142例埃博拉病毒样本,并在24小时内得到分析结果,测序过程需要的时间不到1小时。研究者表示,这显示出在资源缺乏的情况下进行实时基因组监控是可行的。
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